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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
新疆兵团：肉兔养殖“蹦”上致富路******
(新春走基层)新疆兵团：肉兔养殖“蹦”上致富路
中新网乌鲁木齐2月2日电 (戚亚平 胡彩艳)“家养三只兔，不愁油盐醋；家养十只兔，不愁棉和布；家养百只兔，走上致富路。”这是一首在当地职工群众间广为流传的“致富经”。
新疆生产建设兵团第一师十二团九连职工郭云建把农闲时间用在养殖上，通过努力，摇身一变成了十二团塔南片区小有名气的“郭兔王”。
郭云建正在给兔子喂食。 胡彩艳 摄说起“郭兔王”的由来，就要从郭云建养兔开始说起。2019年，郭云建偶然在市场上看见肉兔销售行情异常火爆，便萌生养兔子致富的想法。回家和家人商量后，便在自家田边建起肉兔养殖舍搞养殖。
万事开头难，由于当时养殖技术落后，兔种老化，加上育肥技术不足，出肉率仅32%，郭云建养殖的兔子在市场上不受欢迎。
“养殖初期，无论是饲料搭配还是种兔选择，身边都没有经验借鉴，大多都是靠视频、书籍学习，没过多久兔子就开始大面积生病。”郭云建说，当时心里面确实也想过放弃，但是经过一番思考还是决定坚持下去。
十二团九连党支部知道此事后，做出决定，由九连连长张辉牵头，联系塔里木大学相关养殖技术专家，和十二团农发中心技术人员帮郭云建做诊断。
“当天就为郭云建开出了可行方案，并现场传授他技术。”张辉说。
作为连长，张辉也经常走访郭云建，帮他解决如销路、防疫等困难。
“我的创业之路一开始不平坦，充满了很多的不确定因素，如技术、场地等。”除请教当地养殖技术专家和人员外，郭云建经常到外地考察学习。
经过几年努力，郭云建成功总结出一套适合本地的肉兔养殖技术。兔子数量也从最初几十只，发展到如今800余只。
“养兔子最关键的就是要做好消毒、防疫，温度和饲喂，要防暑防寒。”如今说起兔子养殖，郭云建如数家珍，在生长过程中一定要仔细观察和记录，分栏管理，要保证兔子品种的优良。
郭云建介绍，兔子生长繁殖非常快，70日龄即可上市销售，出肉率可达65%左右。
“去年毛利润是四五十万元，净利润是十几万元，效益很不错，现在到处订单都来了，干起来也很有劲头。”郭云建说。
郭云建的养兔事业步入正轨，不但鼓起自己的钱袋子，也成为塔南片区自主创业的名人和榜样。
为带动更多职工走上致富路，郭云建决定扩大养兔规模，形成肉兔养殖产业链，同时还为有意向的职工提供繁育种兔和适龄母兔，助力职工增收致富。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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